PayUpin peruskäyttö on maksutonta, mutta maksuaikapalvelusta veloitetaan palvelumaksu. PayUpin palvelumaksu on 4,90–9,90 € / esitetty maksuaikaa koskeva pyyntö, riippuen siitä kuinka monelle laskulle maksuaikaa haetaan:
- 1 esitetty lasku = 4,90 €
- 2-3 esitettyä laskua = 7,90 €
- Yli 4 esitettyä laskua = 9,90 €